Les coronavirus chez l’animal et l’homme : Incidence et moyens de prophylaxie

Abstract

Les coronavirus sont une large famille de virus à ARN à simple brin qui se divise en quatre genres : Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus et Deltacoronavirus. Actuellement, seulement sept coronavirus sont reconnus comme pathogènes chez l’homme, dont quatre qui provoquent des symptômes bénins de rhume ou de type grippal chez des personnes immunocompétentes, soit deux Alphacoronavirus (HCoV-NL63, HCoV-229E) et deux Betacoronavirus (HCoV-OC43, HCoV-HKUI). Trois coronavirus causent des infections pouvant être responsables d’une infectionsévère et mortelle. Les deux premiers sont des Betacoronavirus déjà connus : Le virus responsable du syndrome respiratoire aigu sévère (SARS-CoV-2) apparu en Chine et à l’origine de l’épidémie de 2002-2003, et le virus responsable du syndrome respiratoire du Moyen-Orient (MERS-CoV) qui a occasionné l’épidémie de 2012. Le troisième est le SRAS-CoV-2. Il s’agit d’un nouveau Betacoronavirus isolé en janvier 2020, apparenté génétiquement au SARS-CoV. Lors de la réplication, des mutations du SRAS-CoV-2 se produisent avec une fréquence estimée à 1 à 2 mutations par mois, Il s’agit alors d’un « variant » du virus initial. Bien que la plupart de ces mutations soient silencieuses, certains variants ont montré de multiples mutations incluant une modification de la séquence d'acides aminés qui codent les protéines virales. Certaines mutations pourraient affecter la transmissibilité, la sévérité, la performance des tests diagnostiques et l’efficacité des vaccins.